La estructura organizativa de la AFPE se divide en los siguientes equipos de trabajo:
Junta Directiva
Junta Directiva, encargada de representar, coordinar y supervisar la ejecución de las tareas propias de la Asociación.
Todos los cargos de la Junta Directiva son gratuitos y sin ánimo de lucro.
Presidenta
Vicepresidente
Secretario
Tesorero
Vocal
Comisiones de Trabajo
Comisiones de Trabajo, encargada de la ejecución de las tareas propias de cada comisión. Todos los cargos de las Comisiones de trabajo son gratuitos y sin ánimo de lucro.
Comisión Internacional
Equipo Técnico
Equipo Técnico al servicio de la Asociación y de sus Asociados.